后来，炼金术师把金属转变伦理与人性，人与神的关系联系起来，这就使得炼金术充满了宗教神秘主义的色彩。炼制为人治病　长生不老丹药也成为了炼金术的一个重要目标。在炼金术师看来，疾病是因人体处于某种不成熟状态而导致的结果，当人体处于完全成熟状态时，就能长生不老。这种延生通常会使炼金术与占星术　巫术　玄学等其他神秘学说相交错。尽管一般来说，炼金术师都是竭力避免像黑巫师那样使用恶魔符咒，而将自己的学说局限在自然巫术的范围.
四大元素的干粉--贤者之石
贤者之石的概念明显来自上古世纪的一位天才魔法师的四大元素:热、冷、干燥、潮~湿。火是热与干燥，土是热与潮~湿，水与冷是潮~湿，空气是冷与干燥。他进一步建立了"所有金属都是这四种元素的结合"的理论:两个为内部元素、另二个为外部元素。
在这个情况下，一种金属变质成另一种金属的过程，被推论为这四种物质的重组。该物质被想像是用神秘的石头──贤者之石制成的干粉。当时人们相信贤者之石由一种称作carmot的物质构成。
但是理论上是可以实现的，不外乎就是改变分子里面的电子结构。