美国政府为了弄清这怪物的来历，专门装备了一艘快速军舰“林肯号”，去追踪这怪物。
而我呢，是海洋科学家，被聘请担任科学顾问。
“林肯号”搜寻了三个星期，可是一无所获。一天晚上，我正在甲板上眺望夜景。忽然，墨黑的海水里闪出一片红光，红光里隐约有个椭圆形的东西，它不就是我们要寻找的怪物吗？我马上向舰长报告。紧急警报拉响了，全体船员做好战斗准备。
那怪物离我们越来越近，一个水手猛地投出一支锋利的鲸叉。只听得当的一声，鲸叉好像击在了钢板上一样。这怪物好厉害，鲸叉能伤得了它吗？接着，我们朝它开炮，可是炮弹没有爆炸，只是从它的尾部弹了起来，溅起一片水花。这一来可把怪物惹火了，它头上喷出两股水柱，发疯似的向我们的右舷冲来。轰隆一声，我来不及抓住什么，就被抛进了大海。
当我醒来时，发现自己躺在一间铁屋子里。这是怎么回事？我正在发呆，一个高个儿进来，冷笑着说：“先生，我叫尼摩，是被你们称为怪物的这艘潜艇的主人。你成了我的俘虏，也就知道了我的秘密。对不起，为了保密，你得永远留在这儿。先生，我久闻你的大名，知道你学问渊博。你就跟我在海底旅行吧，探求海洋深处的奥秘。”