密折来源不一。有差遣到各地办事官员回朝复命时，受皇帝之命，将所见所闻密报；有的钦差可专折密奏；因派出钦差等人有在外地为非做歹者，康熙四十一年(1702)十月，给督抚密奏并擒拿歹徒之权；大臣、总督、巡抚、提督、总兵官皆许密奏。密奏曾收到一定效果，皇帝增加一个掌握众官员情况的渠道；有些通过其他途径难以查清的问题，经密奏得以明了。
康熙二十三年(1684)十月，奉差福建、广东开海的内阁学士席柱复命时，康熙皇帝向他询问了广东督抚、原任江南总督、河道总督、福建提督等人的情况。当时有一侍卫至铁索桥挂匾，“彼地督抚，馈银六千余两”一事，康熙是从回奏中得知的。康熙五十年(1711),江南科场案被公开揭发后，发生督抚互讦事件。江苏巡抚张伯行疏参两江总督噶礼与考官通同作弊，揽卖举人，胁索银两。噶礼疏劾张伯行挟嫌诬陷，监毙人命等七大罪状，加之审理之人偏袒噶礼，问题呈现复杂状态。康熙皇帝令江苏织造李煦调查、密奏审案实情、江南群众反映、噶礼与张伯行动态等。这对于他力排众议，果断处理此案极为有利。江南三江口及山东地方，盐贼横行，以致官盐雍塞，商旅受害。该地督抚提督总兵官内“并无一人据实奏闻”,而织造“曹寅、李煦有密折启奏”,康熙皇帝闻奏，钦派禁旅，清除盐贼。