卢梭的宗教观素来是为人所热议的话题。他生于信仰加尔文教的日内瓦，后在意大利都灵迫于生计改宗天主教，1754年回日内瓦时又转向加尔文教。这就让人迷惑：他究竟信不信上帝，他是新教徒还是旧教徒？1764年冬，博斯韦尔旅行途中拜访过卢梭，交谈时得知他的游移，随即有疑问，卢梭说他仍是基督徒。[180]1767年5月，《瑞士报》刊登日内瓦人勒盖特（Requete）为舒瓦瑟尔（Etienne Fran?ois de Choiseul）公爵写的诗歌：
我的同胞让-雅克，
作为人并不贤明，
献给公众几部著作，
他不是基督徒，
尽管他说自己是。[181]
卢梭不说自己是无神论者，常以基督徒的身份阐述宗教问题。1769年，他与弗朗科耶尔（Franquières）谈及上帝的启示：“我相信上帝对世人的启示已经很多，倘若有人还未认识到上帝的力量，或是因为他不想认识，或是不需要。”同样在这封信里，他又质疑上帝的绝对权威：“我信仰上帝，却不以为人人要如此，我不知道上帝为什么非要向我们展示他的存在。”[182]所以，卢梭的信仰不是简单的问题，他不只是在旧教与新教之间变换，还有从敬畏上帝到质疑上帝，从信仰天国到关注尘世历史的不同。这与启蒙时代信仰的衰落有关，又是否关乎身心病痛？